Я тоже не православная, поэтому точно не скажу, конечно, но на православных форумах, например, встречала острые дискуссии на эту тему. Фактически это частный случай вопроса о пределах свободы миссионера. Сторонники такой практики считают, что миссионер может отступать от общепринятых правил, если он видит, что следование им может оттолкнуть людей от церкви навсегда. Вероятно, тот священник считает, что лучше причастить заключенных так, чем совсем никак - и тогда, может быть, позже, когда они сблизятся с церковью, они откажутся от дискриминации "опущенных".

Еще раз скажу, что я не знаток и пересказываю свои наблюдения за православными форумами - но мне кажется, если бы у священника спросили, он бы да примерно такое объяснение.